中文名: 生物技術設計工具
英文名: ReCore v1.8.14
資源格式: 光盤鏡像
發行時間: 2009年
制作發行: biosolveit
地區: 美國
語言: 英文
簡介:

語言：英語
網址：http://www.biosolveit.de/ReCore/
類別：生物技術設計工具
與傳統藥物化學致力於產生活性化合物的類似物的策略不同，核心遷越通過保留一個潛在的先導化合物的活性，搜索新的骨架。這個策略中使用的計算工具的目標是與結合相關的性質，而不是與化學結構相關的性質。
基於片段的設計策略可以被用來對骨架遷越提供支持。BioSolveIT 公司CEO Christian Lemmen說，利用計算機的配基設計的主要困難是“能否對結合親和性進行准確預測的問題以及檢測低親和性結合物的能力的問題，這些問題在對於片段的情況下是經常出現的。”他解釋到，BioSolveIT的ReCore是一個基於配基的設計工具，“這個工具通過僅僅選取連接核心片段與其R-基團的向量進行配基結構的提取。”
如其名字所寓意的，ReCore定位並去除分子的核心，並且在3D-片段庫中尋找合適的替代核心，形成一個新的骨架。在這個過程中保持周圍的部件不變以產生一個化學上不同的查詢化合物。ReCore是Patrick Maass在漢堡大學的生物信息學中心與.羅氏公司合作開發的。這個軟件的開發人員最近把它應用在基於小分子晶體結構構象的骨架遷越上（J. Chem. Inf. Model. 2007; doi: 10.1021/ci060094h）。
安裝說明
安裝後將patch復制到安裝目錄 \Recore\recore\下。

Unrar, Mount/Burn, Install.
Put the patch in the \Recore\recore\ and run it.
Note: The program contains RecoreGUI which is/has been a beta for quite
some time, but the main exe is not beta.

nethero@TLF-ED => 806.2MB
NFO:
代碼

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            ▀▀▀          Nearing the edge of the galaxy
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                         ReCore v1.8.14 (c) BioSolveIT
                              Type ..... : Molecular
                              Date ..... : 03/2009
                              Size ..... : 57x15MB
                              OS ....... : Windows
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   ReCore is a computer program for scaffold hopping and core replacement:
   You have a 3D structure of a ligand. ReCore can replace an unwanted part
   (defined by bond cuts) so that the new part respects the dangling bonds
   as good as possible. Additionally, user-defined "pharmacophore features"
   can be employed to direct the search.
   A typical workflow is a two stage process, of which Stage A needs to be
   performed only once:
   Stage A: Shredding of libraries and creation of an index for fast search
   Stage B: Searching the fragment library using a query and the database
   exploiting the index.
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   ░▓█████████████████████▓░  [  INSTALLATION  ]  ░▓██████████████████████▓░
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   Unrar, Mount/Burn, Install.
   Put the patch in the \Recore\recore\ and run it.
   Note: The program contains RecoreGUI which is/has been a beta for quite
         some time, but the main exe is not beta.
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   ░▓████████████▓░    [ Nearing the edge of the galaxy ]   ░▓████████████▓░
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